หน่วยรับรองจะเป็นหน่วยงานที่ใช้ตรวจสอบระบบมาตรฐานคุณภาพทางอาหาร ซึ่งดำเนินการประเมินความเสี่ยงของระบบการผลิต และจัดการข้อมูลของฟาร์มหรือแปลงผลิต ที่ได้รับการขึ้นทะเบียน ไว้ให้พร้อม โดยจะต้องทราบถึงเรื่องต่างๆ ดังต่อไปนี้
- สถานภาพในปัจจุบันและในอดีต
- ผลิตผลที่ได้รับการรับรอง
- พื้นที่ / ปริมาตร
- ผู้ผลิตแต่ละราย (เอกสารแสดงสถานภาพทางกฎหมาย)
- การประเมิน/การตรวจสอบ และรายละเอียดความสอดคล้อง
หน่วยรับรองต้องยื่นขอต่อหน่วยรับรองระบบงาน (Accredited Bodies) เพื่อขอรับการรับรองระบบงานตามระบบมาตรฐาน EN 45011 หรือ ISO/IEC Guide 65 ในขอบข่ายที่เกี่ยวข้องกับ GLOBALGAP (พืช, ปศุสัตว์ และ/หรือ การเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำ) หรือในขอบข่ายที่เกี่ยวข้องกับการเทียบเคียง